Herrera brilló en el Athletic Club durante tres temporadas, en las que disputó 128 partidos y anotó 11 goles. Fue subcampeón de Europa League y Copa en la 2011-12, y dejó al equipo clasificado para la Champions. Es la única vez que ha logrado el Athletic entrar en el torneo en el siglo XXI, en la temporada 2013-14 de la mano de Ernesto Valverde, con quien se reencuentra ahora.
 
Su imaginación con balón, su técnica y sentido táctico le llevaron a triunfar en el Manchester United, con el que disputó 189 encuentros participando entre goles y asistencias en medio centenar de dianas. Herrera ganó cuatro títulos: la FA Cup y Community Shield (2016), y la Europa League y la Copa de la Liga en 2017, año en que fue considerado por su afición mejor jugador de la temporada.
 
Posteriormente, en 2019, recaló en el Paris Saint-Germain, con el que ha disputado 95 encuentros. Ha ganado dos veces la Ligue 1 (2020 y 2022), otras dos la Copa (2020 y 2021), una Copa de la Liga (2020) y dos Supercopas (2019-2020 y 2020-21.). Además, fue subcampeón de la Champions League en 2020 tras perder la final contra el Bayern. Esta campaña, busca reivindicarse tras los problemas físicos del primer año tras su vuelta al Athletic.